Lietuvos sporto enciklopedijos (LSE) rengimo darbai Kūno kultūros ir sporto departamento iniciatyva buvo pradėti dar 1993 m. Enciklopedijos rengimo moksliniu vadovu buvo paskirtas habil. dr. Henrikas Šadžius, kuris kartu su doc. Jonu Žilinsku, pasitelkę daug autorių, recenzentų ir kitų pagalbininkų, organizavo ir koordinavo visus darbus.Tačiau dėl įvairių priežasčių apie 2001 metus darbai nutrūko.
2006 m. kovo–balandžio mėn. pirmajam tomui parengtus straipsnius ir visus kitus dokumentus inventorizavo specialiai tam Kūno kultūros ir sporto departamento sudaryta komisija. Leidėjo funkcijos perduotos VšĮ Lietuvos sporto informacijos centrui, kuriame LSE redakcija jau veikia kaip struktūrinis padalinys.
Departamentas patvirtino Lietuvos sporto enciklopedijos Mokslinę redakcinę tarybą, vadovaujamą prof. habil. dr. Povilo Karoblio. Vyriausiuoju redaktoriumi paskirtas prof. habil. dr. Stanislovas Stonkus. Leidybos ir kitus organizacinius klausimus sprendžia Lietuvos sporto informacijos centro direktoriaus Zigmanto Motiekaičio vadovaujama Darbo grupė.